Departementerne ansvar på regnskabsområdet fremgår af § 7 i regnskabsbekendtgørelsen:

§ 7. Ministeriernes departementer fastsætter i samarbejde med Økonomistyrelsen opdelingen på virksomheder indenfor ministerområdet.

Stk. 2 . Departementerne tilrettelægger regnskabsvæsenet inden for deres områder, herunder omlægninger vedrørende ministerområdets anvendelse af de i § 11 stk. 2 nævnte systemer, og fører kontrol med overholdelsen af reglerne om statens regnskabsvæsen samt sikrer tilvejebringelsen af de oplysninger, der er nævnt i § 1.

Stk. 3. Ved tilrettelæggelsen af regnskabsvæsenet skal departementerne sikre, at virksomhederne og de regnskabsførende institutioner har en sådan størrelse, at de kan gennemføre en forsvarlig tilrettelæggelse af regnskabsvæsenet.

Stk. 4. Hvis dette ikke er muligt skal departementerne på anden måde sikre, at der kan gennemføres en forsvarlig tilrettelæggelse af regnskabsvæsenet eventuelt ved at regnskabsfunktionerne samles i fælles regnskabsmæssige driftscentre eller varetages af eksterne driftscentre.

Stk. 5. Departementerne skal udarbejde en ministerieinstruks, jf. §§ 13-15.

Departementernes ansvar for tilrettelæggelsen af regnskabsvæsenet indenfor ministerområderne indebærer, at departementerne har det overordnede ansvar for at sikre, at reglerne i regnskabsbekendtgørelsen overholdes af de enkelte virksomheder og regnskabsførende institutioner indenfor ministerområderne. Departementerne har endvidere ansvaret for omlægninger i ministerområdernes systemanvendelse på regnskabsområdet (incl. løn- og betalingssystemer), herunder ansvaret for den konkrete tilrettelæggelse af overgangen fra anvendelse af centrale- til lokale økonomisystemer.

Departementernes ansvar for tilrettelæggelsen af regnskabsvæsenet indebærer endvidere, at departementerne indenfor bekendtgørelsens rammer kan og skal udstikke nærmere retningslinier til virksomhederne og de regnskabsførende institutioner omkring regnskabsvæsenets tilrettelæggelse.

Det er ligeledes departementernes ansvar at sikre, at de under ministerområdet hørende virksomheder og regnskabsførende institutioner har en sådan størrelse, at de kan gennemføre en forsvarlig tilrettelæggelse af regnskabsvæsenet og dermed overholde bekendtgørelsens bestemmelser om funktionsadskillelse mellem registrerings- og betalingsfunktionen (§ 30) og mellem systemudvikling m.v. og registrerings/betalingsfunktioner (§ 21).

Hvis der under de enkelte ministerområder findes virksomheder og regnskabsførende institutioner, der ikke kan overholde bestemmelserne om funktionsadskillelse, skal departementerne sikre, at der på anden måde sikres en forsvarlig tilrettelæggelse af regnskabsvæsenet eventuelt ved at samle regnskabsfunktioner i fælles regnskabsmæssige driftscentre eller ved at overlade disse funktioner til eksterne driftscentre.

Driftscentre kan anvendes til varetagelse af såvel fælles IT-opgaver på regnskabsområdet som varetagelse af egentlige regnskabsopgaver (regnskabsmæssig registrering) Driftscenterfunktionen kan både varetages af institutioner indenfor ministerområderne og af eksterne leverandører udenfor ministerområderne.

Anvendelsen af eksterne eller interne driftscentre forudsætter, at der indgås en aftale mellem de berørte parter, der entydigt angiver hvilke opgaver, der skal varetages af centeret. Indgåelsen af en sådan aftale ændrer imidlertid ikke det faktum, at det altid er departementerne og de berørte virksomheder/institutioner, der har det formelle ansvar for, at de i aftalen specificerede opgaver løses forsvarligt og i overensstemmelse med gældende lovgivning.